Когда фильтры загрязняются, станция автоматически (по разности давления) запускает процесс регенерации. Обратный поток воды смывает загрязненный слой фильтрующего материала, который затем сбрасывается в дренаж или канализацию. После этого на фильтрующие элементы наносится новый слой перлита или цеолита. Объем промывных вод составляет не более 0,5% от общего объема очищаемой воды.